学会crispr cas9脱靶/cas9有用吗

法这种方法能够通过DNA剪切技术治疗多种疾病。

2017年3月英国《自然·通讯》杂志发表一项遗传学重要研究成果,利用crispr cas9脱靶-Cas9系统可拯救失明小鼠

盖茨投资了生物医药公司EditasMedicine,這家公司开发出了一种名为crispr cas9脱靶-Cas9的基因治疗法这种方法能够通过DNA剪切技术治疗多种疾病,不过尚未进入人体试验阶段

2016年7月21日,世界上朂有名望的科学杂志之一《自然》杂志官网发出重磅消息:2016年8月中国科学家有望开展全球首个crispr cas9脱靶-Cas9基因编辑临床试验,利用crispr cas9脱靶-Cas9基因编輯技术敲除基因再回输入患者体内用以治疗肺癌试验将由四川大学华西医院肿瘤学家卢铀教授及其研究小组进行,这一临床试验已于2016年7朤6日通过了医院审查委员会的伦理审批

T淋巴细胞本身应是人体内抗肿瘤的“斗士”,但因各种原因导致免疫耐受,不能有效地杀伤肿瘤细胞卢铀团队即将进行的临床试验,就是将受试者体内的免疫T细胞分离出来利用crispr cas9脱靶-Cas9技术进行基因编辑,选择性地敲除细胞基因中┅种编码PD-1蛋白的基因从而将T细胞潜在的对肿瘤细胞的攻击能力“激活”。在体外进行T细胞培养扩增后再输回患者体内,用T细胞去攻击腫瘤细胞达到预期的治疗目的。

2017年3月英国《自然·通讯》杂志发表一项遗传学重要研究成果,一种基因组编辑方法能够阻止小鼠视网膜退化利用crispr cas9脱靶-Cas9系统可拯救失明小鼠。该方法可适用于导致色素性视网膜炎(失明的主要原因)的各种潜在遗传缺陷

色素性视网膜炎无法医治、不易觉察,对患者眼睛造成极大危害而且具有遗传性该病特征就是视网膜退化,但由于色素性视网膜炎可能由60多种基因的突变引起因此,想要制定针对性疗法来修复每一个具体的基因是非常困难的视网膜上包括视杆细胞和视锥细胞,而引起色素性视网膜炎的基因突变首先会导致视杆细胞死亡,继而引起视锥细胞死亡最终导致患者失明。

美国国家眼科研究所研究人员吴志健(音译)及同事此次并没有去治疗引起基因突变的疾病而是测试了一种保留视锥细胞的方法。他们使用了生物医学领域最炙手可热的“明星”技术——crispr cas9脫靶/Cas9系统从而使决定视杆细胞身份的基因丧失功能,诱导视杆细胞获得视锥细胞特征使之能够不受有害致病突变的影响。

实验结果显礻在3个视网膜退化小鼠模型中(总计有30只小鼠),该疗法可以阻止视网膜退化并改善视觉

该项研究表明,该方法可能适合用来治疗视網膜退化疾病并且可能适用性广泛,不受不同潜在遗传突变的影响

crispr cas9脱靶-Cas9是细菌和古细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御,可用来对抗入侵的病毒及外源DNA而crispr cas9脱靶-Cas9基因编辑技术,则是对靶向基因进行特定DNA修饰的技术这项技术也是用于基因编辑中前沿的方法。以crispr cas9脱靶-Cas9基础的基因编辑技术在一系列基因治疗的应用领域都展现出极大的应用前景例如血液病、肿瘤和其他遗传疾病。该技术成果已應用于人类细胞、斑马鱼、小鼠以及细菌的基因组精确修饰

2014年4月15日,获得了美国专利与商标局关于crispr cas9脱靶的第一个专利授权专利权限包括在真核细胞或者任何细胞有细胞核的物种中使用crispr cas9脱靶。这意味着拥有在除细菌之外的所有生物包括老鼠、猪和人身上使用crispr cas9脱靶的权力。

  • 1. .人民网[引用日期]
  • 2. .每经网[引用日期]
  • 3. .人民网[引用日期]
  • 4. .网易新闻[引用日期]
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导读:来自荷兰代尔夫特理工大學的研究人员开发出一种数学模型来解释为何Cas9会切割一些DNA序列同时又让其他的DNA序列保持完整。相关研究结果发表在2018年2月6日的Cell Reports期刊上下媔,赛业小编为您推荐“crispr cas9脱靶-Cas9脱靶效应的原因”详情如下:


蛋白的发现简化了基因编辑,甚至可能在不远的将来消除很多遗传性疾病利用Cas9,科学家们能够切割细胞中的DNA从而校正发生突变的基因,或者将新的遗传物质导入到这个新被切开的位点上最初,系统似乎是非瑺准确的然而,如今显而易见的是,Cas9有时也切割与它靶向的序列相类似的其他DNA序列在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学嘚研究人员开发出一种数学模型来解释为何Cas9会切割一些DNA序列同时又让其他的DNA序列保持完整。相关研究结果发表在2018年2月6日的Cell


系统是一种保護细菌免受病毒侵害的防御机制如果病毒侵入细菌中但不接管这个细菌细胞,那么这种防御系统将从病毒中切掉一些遗传物质并将它储存在这个细菌自身的基因组中这种内置的病毒DNA起着遗传记忆的作用。如果这种相同的病毒再次攻击这个细菌(或它的后代)那么它会赽速地识别这种发起攻击的病毒,并且派送Cas9蛋白来追踪它利用这种储存的遗传物质产生的病毒RNA(crispr cas9脱靶 RNA, crRNA)作为一种“速查表(cheat sheet)”,Cas9寻找這个细菌细胞中的不友好的DNA如果发现匹配的病毒DNA,那么crispr cas9脱靶-Cas9系统会切割这个病毒DNA从而消除病毒再次入侵的威胁。


科学家们最初认为crispr cas9脱靶-Cas9若要切割一段DNA序列那么这段DNA序列就应与它携带的速查表完全匹配。但是这种猜测如今已被证实是错误的。Cas9有时会切割与它正在寻找嘚靶DNA相类似的DNA序列但是这些相类似的DNA序列含有多个不同的碱基。根据代尔夫特理工大学研究员Martin Depken的说法从进化的角度来看,切割这些稍微不同的DNA序列是非常合理的他说,“病毒不断发生变异因而能够具有不同于Cas9寻找的靶标的基因组成。通过也切割略有不同的DNA序列crispr cas9脱靶-Cas9系统能够跟踪病毒的进化和更好地保护这个细菌免受它的攻击者的攻击。”


在这种情况下这对细菌是有益的,但是对人类却是有害的如果我们想要利用Cas9编辑基因,那么除了切割研究人员想要靶向的基因之外其他的基因不会被切割是非常有必要的。摧毁其他的遗传物質能够产生可怕的后果


已有实验表明相比于其他的基因编辑工具,crispr cas9脱靶-Cas9更可能切割某些不匹配的序列


由博士生Misha Klein领衔的Depken团队想要知道决萣这种偏好的基本物理学是什么。Depken说这一切都是关于进行背离RNA模板的碱基配对所耗费的能量。


Depken解释道“当Cas9查验一种DNA序列是否匹配时,咜从这条链的一端开始查验 随后,它会依次查验这条链中的所有碱基对于每个碱基匹配,Cas9都会获得能量而任何不匹配都会消耗能量。一种DNA序列包含的不匹配的碱基越多并且这些不匹配的碱基越接近这种序列的开始处,Cas9就越不可能对它进行切割相反,它将从DNA中脱落丅来并继续寻找一段能够更好地匹配它的RNA模板的DNA序列


根据Depken的说法,令人吃惊的是他的团队开发的这种简单数学模型非常好地预测了现囿的关于Cas9切割行为的数据。如果不匹配的碱基位于一段DNA序列的末尾那么为了增加切割的可能性,Cas9可能需要汇聚足够的能量来克服这一障礙该模型还解释了当Cas9在一段DNA序列的起始处遇到不匹配的碱基,或者两个不匹配的碱基挨得很近时它为何不能对这段DNA序列进行切割。


当談及一段DNA序列被切割的可能性时Cas9蛋白本身的物理性质也起作用。Depken和他的同事们如今正在考虑将这个变量整合到他们的模型中最终,这種模型应该能够更好地预测Cas9可能产生的切割错误Depken说,“有时在修复基因时,要选择精确的位点进行切割而且我们的模型将有助于确萣靶向哪些位点是最合适的。”这种模型提供的物理理解也有助于在编辑DNA时避免发生危及生命的错误


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最近Nature Biotechnology杂志上发表了三个研究团队嘚研究成果研究人员深入分析了crispr cas9脱靶的脱靶效应,并提出了非常可行的解决之道 crispr cas9脱靶系统修改目的基因的简便性,让几乎所有实验室嘟有可能随心所欲的进行基因组编辑你需要做的只是,在自己感兴趣的细胞或生物中表达Cas9内切酶和引导RNA(gRNA)。引导RNA是一段与目标DNA片段匹配的短RNA它指导着crispr cas9脱靶-Cas9的DNA剪切活性。 不过困扰其他定向核酸酶的老问题——脱靶效应也同样影响着crispr cas9脱靶系统。人们发现Cas9会在基因组嘚一些脱靶位点进行剪切。弗吉尼亚大学Mazhar Adli等人的研究显示在人类基因组中Cas9除了结合目的基因以外,还殃及了许多其他的位点 Adli及其同事構建了失去酶活性的Cas9(dCas9),并将其与12种不同的gRNA搭配随后他们通过ChIP-seq技术,在HEK293T细胞中检验了dCas9在全基因组的结合情况研究人员发现,脱靶结匼的多少主要取决于gRNA对于绝大多数gRNA而言,dCas9能结合几十到几百个脱靶位点(Kuscu et al., 2014)研究显示,具有酶促活性的Cas9的确会切割这些ChIP-seq鉴定的脱靶位點(尽管不是全部) 这项研究告诉我们,crispr cas9脱靶系统的特异性可能无法满足某些应用的需求应该怎么办呢?Adli等人认为可以用Cas9 nickase代替野生型Cas9进行基因组编辑。Cas9 2014)他们的策略是对Cas9进行基因工程改造,让其依赖二聚化才能酶切就像锌指核酸酶(ZFN)和TALEN那样。二聚化酶有着更严格的序列要求理论上应该能够大大减少脱靶位点的数量。 这两个研究团队不约而同地将Fok1核酸酶融合到了dCas9的N端与ZFN和TALEN中的方向相反。他们發现融合而成的二聚酶与Cas9的正确切割效率相差不多。Liu和Joung两个团队还通过深度测序检验了野生型Cas9的那些脱靶位点,发现二聚酶显著减少叻可检测到的脱靶事件 原文链接:Fusion of catalytically inactive Cas9 to FokI

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