运动神经元病的治疗需要综合治疗，一般情况下，可以口服维生素e以及维生素b，再就是辅酶肌肉注射，胞二磷胆碱肌肉注射。另外针对肌肉痉挛，可以应用地西泮。

另外可以适用一些药物，比如促甲状腺激素释放激素，干扰素，卵磷脂，睾酮，半胱氨酸，免疫抑制剂以及血浆交换疗法，具有一定的效果。

近年来，干细胞技术发展迅速，干细胞治疗已经成为治疗该病的主要手段之一，能明显的缓解病情。另外要注意进行患肢的按摩，被动的活动。吞咽困难以鼻饲饮食为主，维持营养，水分以及电解质，呼吸肌麻痹的，要呼吸机辅助呼吸为主，要防止肺部感染。

目前还没有治愈运动神经元病的药物，对运动神经元病的治疗，主要就是综合治疗，另外要加强护理，防止呼吸衰竭，防止感染，加强营养